周丰丰

• * 1996-2000: 中国科学技术大学，少年班学院，计算机软件

• * 2000-2005: 中国科学技术大学，计算机学院，计算机软件

教授，博士生导师，中国科学院百人计划，IEEE（美国电气和电子工程师协会）高级会员。团队主要从事健康大数据挖掘核心算法的研究。

于2005年7月获得中国科学技术大学计算机软件与理论专业博士学位，师从中科院院士陈国良院士。于2005年9月在美国乔治亚大学生物信息研究所所长徐鹰教授的实验室担任生物信息学博士后，从事比较基因组学方面的研究，并分别于2008年12月和2009年1月晋升为生物能源计算生物学研究组组长和健康信息学助理研究科学家。2011年被中国科学院深圳先进技术研究院聘用为健康信息学研究员。2015年被304永利集团官网入口聘用为健康大数据教授、博导。

已发表SCI索引学术论文93篇，根据SCI数据库统计，总引用次数1771次，他引次数1366次。学术成果多次在包括Nature Protocols（影响因子9.673，1篇）、Nucleic Acids Research（影响因子9.112， 3篇）、Bioinformatics（影响因子4.981，3篇）、BMC Genomics（影响因子3.986， 2篇）和Genetics（影响因子5.963，1篇）等高水平SCI索引学术期刊上发表。相关成果连续荣获国际疾病预测竞赛2012年度第三名（共55个学术团队参加）和2013年度第四名（共28个学术团队参加）、2014年度第二届中国大数据技术创新大赛（中国计算机学会大数据专家委员会）的成功参与奖、2015年度“中国好创意”全国青年大数据创新大赛（国家互联网信息办公室网络数据与技术局、中国计算机学会）的二等奖、和2020年度阿里云天池大赛“AI开发者创新应用赛”创新奖。应邀担任Computers in Biology and Medicine (SCI索引，影响因子7.700，中科院一区)的副主编、和Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences (SCI索引，影响因子4.800，中科院二区) 副主编，并多次应邀评审国际和国内项目标书、国际学术期刊和会议的投稿论文。

目前已毕业的学生找到的工作机会包括阿里巴巴、百度和南方信投等大数据挖掘领域的大数据分析师等职位，也有多位HILabers选择国内外顶级高校继续深造。欢迎有志于从事大数据领域研究和开发的同学申请和报考本实验室的计算机学院计算机应用专业学术博士、计算机学院的学硕（计算机应用专业）/专硕（电子信息专业）研究生、以及软件工程学院的学硕（软件工程专业）/专硕（电子信息专业）研究生。

* 共同第一作者， # 通信作者，标为红色的是近期论文。以下为部分论文列表，近期论文也可以在搜索引擎中用英文 Fengfeng Zhou 来检索。

1. [1] Meiyu Duan, Yaqing Liu, Dong Zhao, Haijun Li, Gongyou Zhang, Hongmei Liu, Yueying Wang, Yusi Fan, Lan Huang, Fengfeng Zhou#, “Gender-specific dysregulations of nondifferentially expressed biomarkers of metastatic colon cancer”. Computational Biology and Chemistry , 104: 107858, 2023. (影响因子：3.737，分区：3区)

2. [2] Changfan Luo, Yiping Xu, Yongkang Shao, Zihan Wang, Jianzheng Hu, Jiawei Yuan, Yuchen Liu, Meiyu Duan, Lan Huang, Fengfeng Zhou#, “EvaGoNet: An integrated network of variational autoencoder and Wasserstein generative adversarial network with gradient penalty for binary classification tasks”. Information Sciences, 629: 109-122, 2023. (影响因子：8.233，分区：1区)

3. [3] Xiaoying Lv, Xue Li, Shihong Chen, Gongyou Zhang, Kewei Li, Yueying Wang, Meiyu Duan, Fengfeng Zhou#, Hongmei Liu, “Transcriptional Dysregulations of Seven Non-Differentially Expressed Genes as Biomarkers of Metastatic Colon Cancer”. Genes, 14(6): 1138, 2023. (影响因子：4.141，分区：3区)

4. [4] Gancheng Zhu, Yusi Fan, Fei Li, Annebella Tsz Ho Choi, Zhikang Tan, Yiruo Cheng, Kewei Li, Siyang Wang, Changfan Luo, Hongmei Liu, Gongyou Zhang, Zhaomin Yao, Yaqi Zhang, Lan Huang, Fengfeng Zhou#, “GSRNet, an adversarial training-based deep framework with multi-scale CNN and BiGRU for predicting genomic signals and regions”. Expert Systems with Applications, 229: 120439, 2023. (影响因子：8.665，分区：1区)

5. [5] Fei Li, Shuai Liu, Kewei Li, Yaqi Zhang, Meiyu Duan, Zhaomin Yao, Gancheng Zhu, Yutong Guo, Ying Wang, Lan Huang, Fengfeng Zhou#, ” EpiTEAmDNA: Sequence feature representation via transfer learning and ensemble learning for identifying multiple DNA epigenetic modification types across species”. Computers in Biology and Medicine, 160: 107030, 2023. (影响因子：6.698，分区：1区)

6. [6] Shuai Liu, Ruili Chen, Yun Gu, Qiong Yu, Guoxiong Su, Yanjiao Ren, Lan Huang, Fengfeng Zhou#, “AcneTyper: An automatic diagnosis method of dermoscopic acne image via self-ensemble and stacking”. Technology and Health Care: 1-17, 2022. (影响因子：1.205，分区：4区)

7. [7] Ruihao Xin, Xin Feng, Hang Zhang, Yueying Wang, Meiyu Duan, Tunyang Xie, Lin Dong, Qiong Yu, Lan Huang, Fengfeng Zhou#, “Seven non-differentially expressed ‘dark biomarkers’ show transcriptional dysregulation in chronic lymphocytic leukemia”. Personalized Medicine, 2022 (0). (影响因子：2.119，分区：4区)

8. [8] Shuai Liu, Yusi Fan, Kewei Li, Haotian Zhang, Xi Wang, Ruofei Ju, Lan Huang, Meiyu Duan, Fengfeng Zhou#, “Integration of lncRNAs, Protein-Coding Genes and Pathology Images for Detecting Metastatic Melanoma”. Genes, 13(10): 1916, 2022.

9. [9] Meiyu Duan, Yueying Wang, Ya Qiao, Yangyang Wang, Xingyuan Pan, Zhuyu Hua, Yanyue Ran, Xian Fu, Yusi Fan, Lan Huang, Fengfeng Zhou#, “Pan-cancer identification of the relationship of metabolism-related differentially expressed transcription regulation with non-differentially expressed target genes via a gated recurrent unit network”. Computers in Biology and Medicine, 148: 105883, 2022.

10. [10] Shuai Liu, Yusi Fan, Meiyu Duan, Yueying Wang, Guoxiong Su, Yanjiao Ren, Lan Huang, Fengfeng Zhou#, “AcneGrader: An ensemble pruning of the deep learning base models to grade acne”. Skin Research and Technology, 28(5): 677-688, 2022.

11. [11] Qian Wang, Meiyu Duan, Yusi Fan, Shuai Liu, Yanjiao Ren, Lan Huang, Fengfeng Zhou#, “Transforming OMIC features for classification using siamese convolutional networks”. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 20(3): 2250013-2250013, 2022.

12. [12] Yaqi Zhang, Gancheng Zhu, Kewei Li, Fei Li, Lan Huang, Meiyu Duan, Fengfeng Zhou#,“HLAB: learning the BiLSTM features from the ProtBert-encoded proteins for the class I HLA-peptide binding prediction”. Briefings in Bioinformatics, 23(5): bbac173, 2022.

13. [13] Chunyan Tang, Cheng Zhong, Mian Wang, Fengfeng Zhou#, “FMGNN: A method to predict compound- protein interaction with pharmacophore features and physicochemical properties of amino acids”. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 20(2): 1030-1040, 2022.

14. [14] Chengfeng Xu, Ruochi Zhang, Meiyu Duan, Yongming Zhou, Jizhang Bao, Hao Lu, Jie Wang, Minghui Hu, Zhaoyang Hu, Fengfeng Zhou, Wenwei Zhu#, “A polygenic stacking classifier revealed the complicated platelet transcriptomic landscape of adult immune thrombocytopenia”. Molecular Therapy-Nucleic Acids, 28: 477-487, 2022.

15. [15] Daiguo Deng, Zengrong Lei, Xiaobin Hong, Ruochi Zhang*, Fengfeng Zhou*, “Describe Molecules by a Heterogeneous Graph Neural Network with Transformer-like Attention for Supervised Property Predictions”. ACS omega, 7(4): 3713-3721, 2022.

16. [16] Heyu Meng, Yueying Wang, Jianjun Ruan, Yanqiu Chen, Xue Wang, Fengfeng Zhou, Fanbo Meng#, “Decreased Iron Ion Concentrations in the Peripheral Blood Correlate with Coronary Atherosclerosis”. Nutrients, 14(2): 319, 2022.

17. [17] Meiyu Duan, Lei Zhang, Yueying Wang, Yusi Fan, Shuai Liu, Qiong Yu, Lan Huang, Fengfeng Zhou#, “Computational pan-cancer characterization of model-based quantitative transcription regulations dysregulated in regional lymph node metastasis”. Computers in Biology and Medicine, 135: 104571, 2021.

18. [18] Shuai Liu, Zheng Chen, Huahui Zhou, Kunlin He, Meiyu Duan, Qichen Zheng, Pengcheng Xiong, Lan Huang, Qiong Yu, Guoxiong Su, Fengfeng Zhou#, “DiaMole: Mole Detection and Segmentation Software for Mobile Phone Skin Images”. Journal of Healthcare Engineering, 2021: 1-10, 2021.

19. [19] Sida Gao, Puli Wang, Yuming Feng, Xuchen Xie, Meiyu Duan, Yusi Fan, Shuai Liu, Lan Huang, Fengfeng Zhou#, “RIFS2D: A two-dimensional version of a randomly restarted incremental feature selection algorithm with an application for detecting low-ranked biomarkers”. Computers in Biology and Medicine, 133:104405, 2021.

1. [1] 2020年：阿里云天池大赛“AI开发者创新应用赛”创新奖，“智能问诊与辅助推荐系统”，指导老师。

2. [2] 2019年：中国气象局2019年第二届全国智慧气象服务创新大赛“‘神气’大数据算法与应用赛（应用赛）”，三等奖，HI_bioknow代表队，指导老师。

3. [3] 2016年： 国际排名第四，“Systems Toxicology Computational Challenge”, sbv IMPROVER competition 2016, HILab代表队，指导老师。

4. [4] 2015年：“中国好创意”全国青年大数据创新大赛（国家互联网信息办公室网络数据与技术局、中国计算机学会），“基于大数据的未知病原检测方法构建”赛题，二等奖，HI-15MW代表队，指导老师。

5. [5] 2014年：第二届中国大数据技术创新大赛（中国计算机学会大数据专家委员会），HILab_SIAT代表队，成功参与奖，指导老师。

6. [6] 2013年：疾病预警建模算法NetTrans荣获2013年度国际IMPROVER疾病预警建模竞赛第四名（共28个国际团队参加）。颁奖及学术交流会议，希腊雅典，2013年10月29-31日。

7. [7] 2013年：中国科学院“百人计划”。

8. [8] 2013年：深圳市海外高层次人才“孔雀计划”B类人才。

9. [9] 2012年：疾病预警建模算法cPsoriasis荣获2012年度国际IMPROVER疾病预警建模竞赛－自免疫疾病第三名（共55个国际团队参加）。颁奖及学术交流会议，美国波士顿，2012年10月2-3日。

1. [1] 委员（2016-现在，首批委员），中国计算机学会生物信息学专业组，2016年-现在。

2. [2] 委员（2016-现在），中国计算机学会计算机应用专业委员会，2016年-现在。

3. [3] 通讯委员（2016-现在），中国计算机学会大数据专业委员会，2016年-现在。

4. [4] 高级会员（2016年-现在），会员（2013-2016），中国计算机学会，2013-现在。

5. [5] 终身会员（2013－现在），中国运筹学会，2013－现在。

6. [6] 高级会员（2013－现在），会员（2012-2013），国际电子电路工程师协会（IEEE），2012－现在。